Prof. Lorenzo Farina: i libri dei suoi insegnamenti

1. Che cosa si intende per bioinformatica e quali tipi di dati biologici tratta?
2. Come si allinea una sequenza di DNA con un'altra sequenza di riferimento?
3. Che cosa si intende per allineamento globale e locale tra sequenze biologiche?
4. Come si costruisce un albero filogenetico a partire da dati di sequenza?
5. Quali sono le caratteristiche delle banche dati biologiche e come si interrogano?
6. Come si identificano i geni in una sequenza genomica?
7. Che cosa si intende per espressione genica e come si misura con i dati di microarray?
8. Come si modella una rete di interazione tra proteine?
9. Quali metodi si usano per predire la struttura tridimensionale di una proteina?
10. Come si valuta la significatività statistica di un risultato in analisi genomica?
11. Che cosa si intende per modello computazionale di un sistema fisiologico?
12. Come si simula la dinamica di una popolazione cellulare con un modello matematico?
13. Quali applicazioni hanno le tecniche computazionali nella diagnostica medica?
14. Come si elaborano le immagini mediche per estrarre informazioni quantitative?
15. Che cosa si intende per segmentazione di immagini biomediche e quali metodi la realizzano?
16. Come si gestisce la privacy dei dati genomici nelle analisi computazionali?
17. Quali sono le fonti di errore nelle misure ad alto throughput in biologia?
18. Come si integrano dati clinici ed eterogenei per supportare la medicina personalizzata?
19. Che cosa si intende per modello di Markov nascosto applicato a sequenze biologiche?
20. Come si valuta la qualità di un modello computazionale rispetto ai dati sperimentali?

Domande di esercitazione costruite sul programma ufficiale, non fornite dal docente.