Prof. Federico Zambelli

• Slides, notes and selected articles will be shared with students.

Argomenti del programma: Genomics o Experimental design o DNA/cDNA/RNA Sequencing including library preparation and QC o Sequence assembly o Sequence annotation (structural and functional) including GO and metabolic pathways annotations o Reduced representation approaches o Variant calling (including CNV and SV) o Phenotype to genotype association methods (QTL, GWAS) o Repeat annotation and analysis o Reference gene annotations (RefSeq,…

• Le copie delle slide proiettate durante le lezioni, insieme a eventuali materiali aggiuntivi e dataset utilizzati per le esercitazioni, saranno rese disponibili attraverso il sito del corso sulla piattaforma myARIEL dell'Università degli…
• Questo materiale ha lo scopo di supportare le lezioni e lo studio individuale, ma non sostituisce la frequenza regolare del corso, soprattutto per la parte pratica.
• Il materiale è reso disponibile esclusivamente agli studenti e non deve essere distribuito ad altri senza il consenso esplicito dei docenti.

Argomenti del programma: Nella prima parte del corso verranno introdotti i principi fondamentali della programmazione per l'analisi dei dati, utilizzando il linguaggio R come strumento per comprenderne e applicarne i concetti. In particolare, gli studenti acquisiranno familiarità con i seguenti argomenti: - Tipi di dato e variabili. - Strutture dati di base: vettori, fattori, matrici, array e liste. - Funzioni fondamentali del linguaggio R.

Argomenti del programma: Il programma è condiviso con i seguenti insegnamenti: - [FAI-9]( https://www.unimi.it/it/ugov/of/af202700000fai-9 )

Argomenti del programma: First, teachings will introduce students to programming principles for data analysis, using the R programming language as the practice ground for their understanding and application. In particular, students will familiarise themselves with the following concepts: - Data types and variables - Basic data structures: vectors, factors, matrices, arrays, lists. - Basic standard functions in R.

Argomenti del programma: The course will present the computational and methodological basics of bioinformatics analysis of transcriptomic and protein-DNA interaction data. Theoretical explanations will be integrated by hands-on exercises in which students will apply the methods learnt to analyse real case studies.

Argomenti del programma: Programma Introduzione alla Biologia Molecolare Struttura e proprietà delle molecole biologiche DNA RNA Proteine Carboidrati Lipidi Metodologie di Biologia molecolare Parte 1 Enzimi di restrizione. Ibridazione di Southern. Principi di clonaggio. Vettori di clonaggio. Costruzione di una molecola di DNA ricombinante. Costruzione di librerie genomiche.